UNC0638

目录号：S8071 批次号：S807102

化学数据

	别名		储存条件 (自收到货起)	3年 / -20°C / 粉状 1年 / -80°C / 溶于溶剂
	化学式	C₃₀H₄₇N₅O₂
	分子量	509.73	CAS号	1255580-76-7
Solubility (25°C)*	体外	DMSO	100 mg/mL (196.18 mM)
		Water	Insoluble
		Ethanol	Insoluble
* <1 mg/ml means slightly soluble or insoluble. * Please note that Selleck tests the solubility of all compounds in-house, and the actual solubility may differ slightly from published values. This is normal and is due to slight batch-to-batch variations.

制备储备液

生物活性

产品描述

UNC0638 是一种有效的选择性的组蛋白赖氨酸甲基转移酶（HMTase）抑制剂，作用于G9a和GLP，IC50分别为< 15 nM和19 nM，有效且选择性地作用于多种表观遗传和非表观遗传靶点。UNC0638 具有抗病毒的活性。

靶点

G9a ^[1] (Cell-free assay)	GLP ^[1] (Cell-free assay)
<15 nM	19 nM

体外研究

UNC0638是一种有效的，选择性的，可渗透细胞的G9a和GLP的化学探针，相比于BIX01294，毒性/功能比小于6，其毒性/功能比大于100。UNC0638是一种有效的G9a和GLP抑制剂，对广谱的表观遗传和非表观遗传靶点有选择性。UNC0638对SET7/9 (a H3K4 HMTase)，SET8 (a H4K20 HMTase)，PRMT3，以及SUV39H2有大于10,000倍的选择性。在MDA-MB-231细胞中，UNC0638 (48 h处理)以浓度依赖的方式降低H3K9me2水平，IC50 是81 nM。UNC0638处理各种细胞系导致较低的全局H3K9me2水平降低，这与用shRNA降低G9a和GLP观测到的效果是一致的。UNC0638显著降低MCF7细胞的克隆形成能力，降低G9a调控的內源基因的启动子区H3K9me2的丰度，同时影响microRNAs。在小鼠胚胎干细胞中，UNC0638以浓度依赖的方式重新激活G9a沉默的基因和一个报告基因，同时不促进分化。^[1]

体内研究

在小鼠中进行的药物代谢和药代动力学研究表明，UNC0638经静脉注射、腹腔注射或口服途径给药，在体内清除率高、半衰期短、高体积分布和低暴露量^[1]。

推荐的实验操作(此推荐来自于公开的文献所以Selleck并不保证其有效性)

激酶实验	SAHH耦合试验
激酶实验	这个实验在腺苷脱氨酶的作用将腺苷转换为肌苷，利用SAHH分解甲基转移酶产生的S-腺苷高半胱氨酸，形成同型半胱氨酸和腺苷。同型半胱氨酸的浓度通过偶联荧光基团ThioGlo测定。IC50测定，反应缓冲液如下：25 mM 磷酸钾缓冲液pH 7.5，1 mM EDTA，2 mM MgCl₂，含 5 μM SAHH 的0.01% Triton X 100，0.3 U/mL 腺苷脱氨酶，25 μM SAM，以及15 μM ThioGlo。G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3以及SUV39H2分别在25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM 和100 nM的浓度下测量。UNC0638以4 nM 到 16 μM的浓度加入缓冲液。孵育2分钟后，加入组蛋白多肽触发反应，G9a 中加入10 μM H3(1-25)，EHMT1中加入20 μM H3(1-25)，SETD7中加入100 μM H3(1-25) ，SETD8中加入500 μM H4(1-24)，PRMT3中加入10 μM H4(1-24) ，SUV39H2中加入200 μM H3K9Me1 (1-15)。在384孔板中，用Biotek Synergy2 plate reader在360/40 nm 感光片和528/20 nm滤光片下观测甲基化反应过程中荧光的变化，持续20分钟。扣除实验背景后，用Sigmaplot计算IC50。计算两组独立实验的标准差。
细胞实验	细胞系	MCF7, U2OS 和 H1299细胞
	浓度	3 μM
	处理时间	65 h
	方法	将约为5×10⁵的细胞铺于75 cm²烧瓶中。MCF7和U2OS细胞培养于不含酚红、而包含Earl's salts、10% FBS、1 mM Pyruvate、2 mM Glutamine和1×非必需氨基酸的MEM培养基中。H1299细胞培养于含酚红和10% FBS、1×Anti-Anti的DMEM培养基中。向培养基中加入3 μM UNC638A或等体积DMSO。将烧瓶置于37℃/5% CO₂培养箱中。65小时后，收集培养基、离心以移除其中细胞碎片。将10-15 mL培养基与HPLC级别的氯仿混合，轻轻摇晃，然后静置，知道有机层和水层分离开来。收集有机相，用无水Na₂SO₄进行干燥，然后真空中收集浓缩。剩余残渣溶于100 μL 甲醇，进行后续分析。
动物实验	动物模型	Swiss albino mice
	剂量	IV, 1 mg/kg; PO, 3 mg/kg; IP, 2.5 mg/kg
	给药处理	i.v./i.p./oral

参考文献

[1] Vedadi M, et al. Nat Chem Biol, 2011, 7(8), 566-574.

UNC0638在文献中得到引用

The ARID1A-METTL3-m6A axis ensures effective RNase H1-mediated resolution of R-loops and genome stability [ Cell Rep, 2024, 43(2):113779]	PubMed: 38358891
Transcriptome-based chemical screens identify CDK8 as a common barrier in multiple cell reprogramming systems [ Cell Rep, 2023, 42(6):112566]	PubMed: 37235474
Inhibition of the CtBP complex and FBXO11 enhances MHC class II expression and anti-cancer immune responses [ Cancer Cell, 2022, 40(10):1190-1206.e9]	PubMed: 36179686
Influenza A virus NS1 protein hijacks YAP/TAZ to suppress TLR3-mediated innate immune response [ PLoS Pathog, 2022, 18(5):e1010505]	PubMed: 35503798
Epigenetic Dysregulation Induces Translocation of Histone H3 into Cytoplasm [ Adv Sci (Weinh), 2021, e2100779]	PubMed: 34363353
Histone Methyltransferase G9a Promotes the Development of Renal Cancer through Epigenetic Silencing of Tumor Suppressor Gene SPINK5 [ Oxid Med Cell Longev, 2021, 2021:6650781]	PubMed: 34336110
Synergistic Anti-Tumor Effect of Combining Selective CDK7 and BRD4 Inhibition in Neuroblastoma [ Front Oncol, 2021, 11:773186]	PubMed: 35198433
HeLa TI cell-based assay as a new approach to screen for chemicals able to reactivate the expression of epigenetically silenced genes [ PLoS One, 2021, 16(6):e0252504]	PubMed: 34115770
TBC1D3 promotes neural progenitor proliferation by suppressing the histone methyltransferase G9a [ Sci Adv, 2021, 7(3)eaba8053]	PubMed: 33523893
Targeting p53 and histone methyltransferases restores exhausted CD8+ T cells in HCV infection. [ Nat Commun, 2020, 11(1):604]	PubMed: 32001678

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