UNC0638

UNC0638 是一种有效的选择性的组蛋白赖氨酸甲基转移酶(HMTase)抑制剂,作用于G9aGLPIC50分别为< 15 nM和19 nM,有效且选择性地作用于多种表观遗传和非表观遗传靶点。UNC0638 具有抗病毒的活性。

UNC0638 Chemical Structure

UNC0638 Chemical Structure

CAS: 1255580-76-7

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Histone Methyltransferase抑制剂选择性比较

细胞实验数据示例

细胞系 实验类型 给药浓度 孵育时间 活性描述 文献信息
H1299 cells Function assay 0.25 uM 24 h Inhibition of G9a expressed in H1299 cells assessed as inhibition of dimethylation of p53 at lys 373 at 0.25 uM after 24 hrs by Western blot analysis 21780790
MDA-MB-231 cells Function assay 48 h Inhibition of G9a in human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by clonogenic assay, IC50=0.081 μM 22975593
22Rv1 cells Function assay Inhibition of G9a in human 22Rv1 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.048 μM 21780790
PC3 cells Function assay Inhibition of G9a in human PC3 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.059 μM 21780790
MCF7 cells Function assay Inhibition of G9a in human MCF7 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.07 μM 21780790
IMR90 cells Function assay Inhibition of G9a in human IMR90 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.12 μM 21780790
HCT116 cells Function assay Inhibition of G9a in human HCT116 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.21 μM 21780790
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生物活性

产品描述 UNC0638 是一种有效的选择性的组蛋白赖氨酸甲基转移酶(HMTase)抑制剂,作用于G9aGLPIC50分别为< 15 nM和19 nM,有效且选择性地作用于多种表观遗传和非表观遗传靶点。UNC0638 具有抗病毒的活性。
靶点
G9a [1]
(Cell-free assay)
GLP [1]
(Cell-free assay)
<15 nM 19 nM
体外研究(In Vitro)
体外研究活性 UNC0638是一种有效的,选择性的,可渗透细胞的G9aGLP的化学探针,相比于BIX01294,毒性/功能比小于6,其毒性/功能比大于100。UNC0638是一种有效的G9a和GLP抑制剂,对广谱的表观遗传和非表观遗传靶点有选择性。UNC0638对SET7/9 (a H3K4 HMTase),SET8 (a H4K20 HMTase),PRMT3,以及SUV39H2有大于10,000倍的选择性。在MDA-MB-231细胞中,UNC0638 (48 h处理)以浓度依赖的方式降低H3K9me2水平,IC50 是81 nM。UNC0638处理各种细胞系导致较低的全局H3K9me2水平降低,这与用shRNA降低G9a和GLP观测到的效果是一致的。UNC0638显著降低MCF7细胞的克隆形成能力,降低G9a调控的內源基因的启动子区H3K9me2的丰度,同时影响microRNAs。在小鼠胚胎干细胞中,UNC0638以浓度依赖的方式重新激活G9a沉默的基因和一个报告基因,同时不促进分化。[1]
激酶实验 SAHH耦合试验
这个实验在腺苷脱氨酶的作用将腺苷转换为肌苷,利用SAHH分解甲基转移酶产生的S-腺苷高半胱氨酸,形成同型半胱氨酸和腺苷。同型半胱氨酸的浓度通过偶联荧光基团ThioGlo测定。IC50测定,反应缓冲液如下:25 mM 磷酸钾缓冲液pH 7.5,1 mM EDTA,2 mM MgCl2,含 5 μM SAHH 的0.01% Triton X 100,0.3 U/mL 腺苷脱氨酶,25 μM SAM,以及15 μM ThioGlo。G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3以及SUV39H2分别在25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM 和100 nM的浓度下测量。UNC0638以4 nM 到 16 μM的浓度加入缓冲液。孵育2分钟后,加入组蛋白多肽触发反应,G9a 中加入10 μM H3(1-25),EHMT1中加入20 μM H3(1-25),SETD7中加入100 μM H3(1-25) ,SETD8中加入500 μM H4(1-24),PRMT3中加入10 μM H4(1-24) ,SUV39H2中加入200 μM H3K9Me1 (1-15)。在384孔板中,用Biotek Synergy2 plate reader在360/40 nm 感光片和528/20 nm滤光片下观测甲基化反应过程中荧光的变化,持续20分钟。扣除实验背景后,用Sigmaplot计算IC50。计算两组独立实验的标准差。
细胞实验 细胞系 MCF7, U2OS 和 H1299细胞
浓度 3 μM
孵育时间 65 h
方法

将约为5×105的细胞铺于75 cm2烧瓶中。MCF7和U2OS细胞培养于不含酚红、而包含Earl's salts、10% FBS、1 mM Pyruvate、2 mM Glutamine和1×非必需氨基酸的MEM培养基中。H1299细胞培养于含酚红和10% FBS、1×Anti-Anti的DMEM培养基中。向培养基中加入3 μM UNC638A或等体积DMSO。将烧瓶置于37℃/5% CO2培养箱中。65小时后,收集培养基、离心以移除其中细胞碎片。将10-15 mL培养基与HPLC级别的氯仿混合,轻轻摇晃,然后静置,知道有机层和水层分离开来。收集有机相,用无水Na2SO4进行干燥,然后真空中收集浓缩。剩余残渣溶于100 μL 甲醇,进行后续分析。

体内研究(In Vivo)
体内研究活性 在小鼠中进行的药物代谢和药代动力学研究表明,UNC0638经静脉注射、腹腔注射或口服途径给药,在体内清除率高、半衰期短、高体积分布和低暴露量[1]
动物实验 Animal Models Swiss albino mice
Dosages IV, 1 mg/kg; PO, 3 mg/kg; IP, 2.5 mg/kg
Administration i.v./i.p./oral

化学信息&溶解度

分子量 509.73 分子式

C30H47N5O2

CAS号 1255580-76-7 SDF Download UNC0638 SDF
Smiles CC(C)N1CCC(CC1)NC2=NC(=NC3=CC(=C(C=C32)OC)OCCCN4CCCC4)C5CCCCC5
储存条件(自收到货起)

体外溶解度
批次:

DMSO : 100 mg/mL ( 196.18 mM; DMSO吸湿会降低化合物溶解度,请使用新开封DMSO)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

摩尔浓度计算器

体内溶解度
批次:

现配现用,请按从左到右的顺序依次添加,澄清后再加入下一溶剂

动物体内配方计算器

实验计算

摩尔浓度计算器

质量 浓度 体积 分子量

动物体内配方计算器(澄清溶液)

第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)

mg/kg g μL

第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶于水的药物;不同批次药物配方比例不同,请联系Selleck为您提供正确的澄清溶液配方)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

计算结果:

工作液浓度: mg/ml;

DMSO母液配制方法: mg 药物溶于μL DMSO溶液(母液浓度mg/mL,:如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请先联系Selleck);

体内配方配制方法:μL DMSO母液,加入μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入μL ddH2O,混匀澄清。

体内配方配制方法:μL DMSO母液,加入μL Corn oil,混匀澄清。

注意:1. 首先保证母液是澄清的;
2.一定要按照顺序依次将溶剂加入,进行下一步操作之前必须保证上一步操作得到的是澄清的溶液,可采用涡旋、超声或水浴加热等物理方法助溶。

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