YTHDC1 Antibody (Rabbit mAb) [A18C13]

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生物描述

特异性 YTHDC1 Antibody (Rabbit mAb) [A18C13] 可检测内源性 YTHDC1 总蛋白水平。
背景 YTHDC1,又名YT521-B,是一种核内YTH结构域蛋白,它作为一种选择性m6A RNA“读取器”和前体mRNA加工的关键调控因子,将表观转录组标记与选择性剪接、选择性多聚腺苷酸化和核输出相偶联,从而在发育和疾病过程中调控基因表达程序。该蛋白包含一个C端YTH结构域,可特异性识别靶RNA中的N6-甲基腺苷;以及一个N端区域,可与SR家族剪接因子相互作用,从而将外显子或3′UTR中的甲基化顺式元件与反式作用的剪接体组分连接起来。 YTHDC1 与含 m6A 的区域结合,通过将 SRSF3 募集到相邻的 RNA 基序来促进外显子包含,同时阻断 SRSF10 的结合(SRSF10 通常驱动外显子跳跃),因此 YTHDC1-m6A 复合物倾向于 SRSF3 样剪接模式,并拮抗 SRSF10 相关的外显子排除。YTHDC1 调控的外显子与 SRSF3 靶标重叠,并拮抗 SRSF10 调控的事件。YTHDC1 的缺失会破坏这些包含/跳跃的决定,而这种破坏只能被具有 m6A 结合能力的野生型 YTHDC1 所恢复,这表明 m6A 识别对其剪接功能至关重要。除了外显子选择外,YTHDC1 还通过与 CPSF6、SRSF3 和 SRSF7 的相互作用来调节选择性多聚腺苷酸化,影响远端与近端多聚腺苷酸化位点的选择,从而在卵母细胞生长、胚胎发生以及其他转录本异构体平衡至关重要的环境中调节 3′UTR 的长度和调控内容。YTHDC1 还参与 m6A 标记 mRNA 的核输出,促进 SRSF3 和输出受体 NXF1 与这些转录本的结合,使其成为连接甲基化状态、剪接位点使用和输出能力的转录-加工轴上的协调者。在肢体器官发生过程中,存在一条特定的 METTL16-m6A-YTHDC1 轴,其中 YTHDC1 识别染色质相关 RNA 上 METTL16 沉积的 m6A,并组织对细胞周期进程和 DNA 修复至关重要的基因的共转录剪接; YTHDC1 或 METTL16 的缺失(而非 METTL3 的缺失)会导致严重的肢体畸形、全基因组转录停滞以及发育基因表达的广泛紊乱。染色质结合的 YTHDC1 通过其 C 端区域富含精氨酸的基序驱动的液-液相分离,将剪接因子募集到转录复合物中,这表明 YTHDC1 不仅能读取 m6A 修饰,还能形成动态的核凝聚体,将剪接机制集中在活跃转录的位点。在成肌系统中,m6A-YTHDC1 调控在成肌细胞中发挥关键功能的 mRNA 的剪接,并促进成肌细胞增殖和肌肉干细胞活性,将其剪接作用与组织特异性生长和再生程序联系起来。在各种癌症中,包括 YTHDC1 在内的含 YTH 结构域的蛋白质经常出现异常表达,而 YTHDC1 表达的改变会影响剪接模式、mRNA 输出以及癌基因和抑癌基因的稳定性。越来越多的证据表明,YTHDC1 驱动的异构体使用和 RNA 代谢的变化与多种癌症类型的肿瘤发生有关。

使用信息

抗体应用 WB, IHC, IF, FCM 稀释比例
WB IHC IF FCM
1:1000 1:500 1:50 1:500
反应性 Mouse, Rat, Human
抗体类型 Rabbit Monoclonal Antibody MW 85 kDa
储存液配方 PBS, pH 7.2+50% Glycerol+0.05% BSA+0.01% NaN3
储存条件
(自收到货起)
-20°C (avoid freeze-thaw cycles), 2 years

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