Flavopiridol (L86-8275)

CDK1/cyclin B1 激酶实验中, 激酶反应包含100 ng表达 GST-CDK1/cyclin B1(人)复合体的 杆状病毒, 1 μg 组蛋白 HI, 0.2 μCi [γ-³³P]ATP, 25 μM ATP溶于 50 μL 激酶buffer (50 mM Tris, pH 8.0, 10 mM MgCl₂, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT)。CDK2/cyclin E 激酶实验中, 激酶反应包含5 ng表达 GST-CDK2/cyclin E (人)复合体的杆状病毒, 0.5 μg GST-RB 融合蛋白(成视网膜细胞瘤蛋白776-928 氨基酸), 0.2 μCi [γ-³³P]ATP, 25 μM ATP溶于 50 μL 激酶buffer (50 mM Hepes, pH 8.0, 10 mM MgCl₂, 1 mM EGTA, 2 mM DTT)。CDK4/cyclin D1激酶实验中, 激酶反应含150 ng 表达GST-CDK4/cyclin D1 (人)的杆状病毒, 280 ng Stag-cyclin D1, 0.5 μg GST-RB 融合蛋白(成视网膜细胞瘤蛋白776-928 氨基酸), 0.2 μCi [γ-³³P]ATP, 25 μM ATP 溶于50 μL激酶 buffer (50 mM Hepes, pH 8.0, 10 mM MgCl₂, 1 mM EGTA, 2 mM DTT)。30^oC下， CDK1 和CDK2反应温育45分钟， CDK4反应温育1小时，加入终浓度为15%的冰冻三氯乙酸(TCA) 终止反应。 使用Filtermate通用收集器，收集TCA沉淀物转移到GF/C 非过滤板上， 使用TopCount 96孔液体闪烁计数器测量过滤数。Flavopiridol溶于 10 mM二甲基甲酰胺(DMF) 中，测定六种浓度，每种重复测三次。实验中 DMF终浓度为 2%。通过回归曲线分析获得IC50值，变异系数为 16%。测定Flavopiridol作用于 CDK6的活性, 进行过滤-结合实验。 反应混合物按如下结合： 2 μL CDK6 (0.7 mg/μL), 5 μL 组蛋白 H1 (6 mg/mL), 14 μL 激酶 buffer (60 mM β-甘油磷酸, 30 mM p-磷酸硝基苯酯, 25 mM MOPS (pH 7.0), 5 mM EGTA, 15 mM MgCl₂, 1 mM DTT, 0.1 mM 钒酸钠), 在50% DMSO中稀释的 3 μL 浓度不断增长的Flavopiridol ，及6 μL ³³P-ATP (1 mCi/mL)，非放射性 ATP，浓度为90 μM，(终浓度为15 μM)。加入³³P-ATP开始反应。 反应在30^oC下温育20分钟。25 μL等分的上清液点样到 Whatman P81 磷酸纤维素膜上。使用1% 磷酸溶液冲洗过滤器5次。 在1 mL闪烁液存在时测定湿过滤器。使用 50 nM 重组Cdk9/cyclin T在 50 mM HEPES pH 7.5, 10 mM MgCl₂, 1 mM DTT, 3 μM Na₃VO₄, 150 μM RNA 聚合酶CDT 肽和80 μM ATP中测定Cdk9活性。在相同buffer中使用37 nM纯化激酶，在200 μM ATP 存在时，10 μM 髓鞘蛋白（MBP）作为底物，进行Cdk7检测实验。使用强阴离子交换剂-为基础的检测实验或闪烁接近实验测定Flavopiridol 作用于CDK9和CDK7的效果。通过剂量反应曲线计算IC50值。

使用不同浓度 Flavopiridol 处理细胞72小时，加入四唑染料，MTS和吩嗪硫酸甲酯。3 小时后,在492 nm处测定吸光值,与存活细胞数成比例。结果表示为IC50值。为了分析细胞周期，细胞在仲甲醛和乙醇中混合，冲洗，然后再悬浮在TdT 酶和 FITC-dUTP染色液中,再冲洗，使用PI染色，随后进行RNA酶处理，最后使用流式细胞仪分析。